全台大罷免落幕後，民進黨內幹部相繼請辭，總統賴清德週四（8月28日）表示「黨團改選會更符合社會的期待」；民進黨內發動立委連署推動黨團改組，此舉被外界解讀為對黨團總召柯建銘的逼宮。對此，柯建銘週五（29日）再度向媒體重申「此時無聲勝有聲」。不過後續有媒體獨家報導指出，賴清德曾數度與柯建銘懇談，雙方未達成共識下才引發後續的連署。
綜合媒體報導，民進黨團的甲級動員通知，預定於29日上午在立法院議場內召開黨團大會。柯建銘在會前被問及為何選在議場召開黨團大會時，他表示，當日要表決的特別條例和追加預算案都很簡單，「這沒什麼特殊安排，不要想太多」。至於週四（28日）傳出他遭總統府秘書長潘孟安勸退，其妻還為他淚訴的報導，他則予以否認，並表示不會再對此發表任何回應。
《自由時報》29日獨家報導，一位知情人士回顧罷免過程中的多項決策點，指出黨內原定調「公民團體在前、民進黨在後」，但柯建銘卻對外稱罷免是總統大選後就決定提出，此舉與內部決議及實際情形並不一致。
該人士表示，罷免策略原規劃為「精準罷免」，鎖定亂刪預算、亂提案的立委，聚焦國會亂象訴求。但柯建銘喊出「大罷免大成功」，並執意推動高虹安罷免案，還對外稱成功後要換立法院長韓國瑜，導致在野黨抓住攻防點。該人士表示，當時的勸阻與冷靜分析都不被接受，而柯建銘也曾說過「不成功就辭總召」。
知情人士透露，黨內普遍認為柯建銘勞苦功高，並非要尋找戰犯。但黨內外均憂心未來行政與立法部門的溝通協調，認為過去的「堅壁清野、焦土戰術」路線勢必要調整。即便民進黨有黨團自主的傳統，各方仍希望黨內「大人們」出面解決。
據報導，兼任民進黨主席的賴清德總統曾與柯建銘懇談，盼他履行承諾退居二線、栽培年輕人，但柯不同意。此後，賴清德才責成黨秘書長徐國勇邀集派系討論。隨著黨內立委連署已超過6成，某種程度上顯示多數派系也認為到了需要調整的時候。至於具體如何處理，會期結束後各派系將進一步與黨團共商。
