藍白合最終協商週三（11月15日）早上10點於 馬英九 文教基金會登場，過程由中華民國前總統馬英九見證。不料台灣媒體《鏡週刊》當天稍早爆料，馬英九基金會執行長 蕭旭岑 曾在本月2日至5日赴北京，回國後隨即拋出前馬英九的全民調主張。對此，蕭旭岑15日並表示，此行純為學術上的交流，他也未見週刊所稱的國台辦等人士。
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《鏡週刊》披露，在馬英九本月10日拋出全民調主張前，蕭旭岑恰巧訪問中國3天，出席北京釣魚台賓館一場論壇活動，照片還登上官媒。由於蕭旭岑在北京期間，曾會見國台辦主任宋濤，是否觸及藍白整合議題，格外引發聯想。
對此，蕭旭岑回應表示，北京論壇是國際知名學術論壇，今年是20週年，邀請前日本首相鳩山由紀夫等重量級貴賓，與會的都是大學校長與學者；另外，今年7月馬英九基金會邀請北京大學等5所大學師生來訪，北大書記郝平當時就邀請馬英九基金會率領學者參加。
蕭旭岑指出，此行純為學術上的交流，他也未見過國台辦等人士，包括東吳、文化2位大學校長，以及9位國內學者等人，都隨同馬英九基金會參加北京論壇，完全扯不上政治，「問問這些校長學者就知道了。」
